Aby właściwe zorganizować proces nauczania przyrody, nauczyciel na bazie podstawy programowej i wybranego programu nauczania powinien opracować harmonogram wycieczek i zajęć terenowych w cyklu 3-letnim, który przedstawia na początku każdego roku szkolnego dyrekcji szkoły, rodzicom i uczniom oraz każdorazowo informuje o wyjściu wychowawcę i nauczycieli uczących w danej klasie. Aby w pełni zrealizować podstawę programową przyrody i rozbudzić w uczniach zainteresowanie przedmiotem, szkoła powinna zapewnić warunki do bezpiecznego prowadzenia zajęć badawczych i terenowych, obserwacji i doświadczeń. Część obserwacji i doświadczeń powinna mieć charakter ciągły lub okresowy w powiązaniu np. ze zmianami pór roku lub stanów pogody. Dla harmonijnego i pełnego przebiegu procesu kształcenia przyrodniczego wskazane jest, aby w organizacji pracy szkoły nastąpiło połączenie w tygodniowym planie zajęć, 2 godzin lekcyjnych przeznaczonych dla przedmiotu, w celu właściwego prowadzenia zajęć w terenie, obserwacji i doświadczeń.